2026 Những câu lệnh để tương tác cơ sở dữ liệu NCBI

 2026 Những câu lệnh để tương tác cơ sở dữ liệu NCBI 

Để thực hiện thiết kế mồi hoặc kiểm tra thông tin gen trên các cây lương thực, hãy hướng dẫn sinh viên sử dụng các công cụ sau:

1. Tra cứu trình tự Gen: Truy cập NCBI Nucleotide. Nhập tên gen + tên cây (ví dụ: OsSub1A rice cho lúa hoặc MeNAM cassava cho sắn).

2. Thiết kế mồi Online: Sử dụng công cụ Primer3Plus hoặc NCBI Primer-BLAST.

3. Dữ liệu bộ gen chuyên biệt:

   • Lúa: Gramene hoặc RiceData.

   • Ngô: MaizeGDB.

   • Sắn: Phytozome (Manihot esculenta), Cassavabase 

   • Khoai lang: Sweetpotatobase.